梱包・包装に使われる材料や容器は、殺菌して使われることもあります。殺菌方法はさまざまあり、材質によっても変わります。加熱殺菌は、名前の通り熱を加えて殺菌します。高温に耐えられる材料や、金属の缶・フタなどに使われます。放射線殺菌法は、y線で殺菌をするので、透過が大きいというメリットがあります。ダンボールなど箱に入ったままのものを、開けずに外側から殺菌することができます。紫外線殺菌方法は、表面のみの殺菌になってしまうので、薬液殺菌と併用することが推奨されているそうです。ガス殺菌は、エチレンオキサイドガス・炭酸ガスを混合したものを使用しています。他にも薬液殺菌という方法があり、効果が確実を言われています。しかし過酸化水素が多く使用されており、残留問題が議論されることもある状態だそうです。